1997年，重庆直辖市成立，重庆资本市场的迅速发展，原挂靠在市政府办公厅的重庆市证券管理办公室已不能适应证券市场监管的要求。为了强化证券市场监管，保证重庆资本市场长期稳定、健康发展，经重庆市政府批准，重庆市证券监督管理办公室于1997年10月正式挂牌成立，为市政府直属正局级事业单位。1998年9月，根据国务院调整证券市场监管体系的精神和国发[1998]29号文，重庆市证券监督管理办公室改由中国证券监督管理委员会垂直管理，改称中国证券监督管理委员会重庆证券监管办事处，为中国证监会直属正局级驻渝机构（简称中国证监会重庆直属办），1999年7月1日正式挂牌。2004年3月1日，根据《关于中国证券监督管理委员会派出机构设置和人员编制的批复》(中央编办复字[2004]11号)的规定,中国证券监督管理委员会重庆直属办更名为中国证券监督管理委员会重庆监管局（简称重庆证监局），为正局级派出机构。内设综合处、上市公司监管处、机构监管处、期货监管处、稽查处和党委办公室(纪检办)。