基金监管部下设六个处，即综合处、监管一、二、三、四、五处，各处职责如下：

综合处：负责部内行政文秘事务、综合协调、基金信息报送和数据统计、对外信息发布；

监管一处：负责拟定基金管理公司及高管人员业务规则并实施监管；

监管二处：负责拟定托管银行业务规则并实施监管，负责基金信息披露、基金投资与交易行为监管；

监管三处：负责拟定基金产品的业务规则并实施监管；

监管四处：负责拟定合格境外机构投资者（QFII）、基金管理公司合格境内机构投资者（QDII）等国际业务规则并实施监管；

监管五处：负责拟定基金销售的业务规则并实施监管。