机构监管部内设综合处、审核处、检查一处、检查二处、检查三处和检查四处，共6个处，各处的主要职责是：
    1、综合处负责部内公文审核、综合类文件办理、文件档案管理；机构监管信息统计、机构监管信息系统建设、信息报送制度、非现场检查月报、信息公示、年报分析等工作；行政文秘事务、部内日常工作的组织协调；领导交办的其他事务。
    2、审核处负责实施证券机构类行政许可事项，并研究制定审核事项的相关规则；指导、监督派出机构的行政许可审核工作；负责证券公司创新产品的审核及相关规则的制定；开展证券公司业务创新及政策的研究工作等。
    3、检查一处负责深圳、广东、广西、陕西、河南、湖南、湖北、海南等地区证券公司及外国证券类机构驻华代表处的监管。
    4、检查二处负责上海、浙江、江西、福建、厦门、山东、江苏、宁波、吉林、青海、安徽、甘肃、青岛等地区证券公司及外国证券类机构驻华代表处的监管。
    5、检查三处负责北京、重庆、四川、黑龙江、大连、辽宁、新疆、河北、宁夏、天津、西藏、贵州、云南、内蒙古、山西等地区证券公司及外国证券类机构驻华代表处的监管。

6、检查四处负责证券投资咨询机构、财务顾问机构、资信评级机构等证券服务机构方面的工作。